კახეთის რეგიონში წყლის დაბინძურების მხრივ უნუგეშო სტატისტიკაა. სანიტარულ-ქიმიური კვლევების მიხედვით, რეგიონის უმეტეს რაიონებში ფიქსირდება ნორმების გადაცდომა. უკანონო ნაგავსაყრელები, დაბინძურებული ზედაპირული წყლები, სათავე ნაგებობებთან ახლოს მდებარე სასაფლაოები და ქალაქის კანალიზაციები კახეთის სოფლებისა და ქალაქების მოსახლეობას სხადასხვა დაავადების საფრთხეს უქმნის. 400 000 -მდე ადამიანით დასახლებული რეგიონის არც ერთ ქალაქში კანალიზაციის წყლის გამწმენდი ნაგებობა არ არსებობს.