მიხეილ სააკაშვილი ექიმ ნიკოლოზ სააკაშვილის პირველი შვილია, რომელიც მას გიული ალასანიასთან თანაცხოვრებისას შეეძინა. წყვილი ერთმანეთს რამდენიმე წელში დაშორდა და ნიკოლოზ სააკაშვილმა მეორედ სვეტლანა სააკაშვილზე იქორწინა. რამდენიმე წლის წინ ქალბატონი სვეტლანა გარდაიცვალა. ბავშვობაში დედასთან ერთად გადაღებულ ფოტოს დავით სააკაშვილი აქვეყნებს და წერს, რომ ძალიან ენატრება.
მიხეილ სააკაშვილს ორი ძმა ჰყავს, დავითი და გიორგი. დავითს საზოგადოება კარგად იცნობს, ის ძმის პრეზიდენტობის პარალელურად რამდენიმეჯერ გაეხვა სკანდალში. წლების წინ, ჯერ კიდევ ბიძინა ივანიშვილის ხელისუფლებაში მოსვლამდე, მედიაში იწერებოდა, რომ მაშინდელი მაღალჩინოსანი ხატია დეკანოიძე მიხეილ სააკაშვილის ძმას დავითს გაყვა ცოლად. მაშინ დავითსა და თეა მოსიძეს ორი შვილი ჰყავდათ. ზუსტად წელიწადნახევარში ტაბლოიდები წერდნენ, რომ ხატია და დავითი ერთმანეთს დაშორდნენ და მამაკაცი ყოფილ ცოლს შეურიგდა. მოგვიანებით დავითს კიდევ ერთი ქალიშვილი შეეძინა.
დავითი კიდევ ერთხელ გაეხვა სკანდალში, როდესაც 2017 წელს უკრაინაში დააპატიმრეს, თუმცა მალე გაათავისუფლეს. მაშინ რადას ერთ-ერთი დეპუტატი აცხადებდა, რომ პოლიციაში სააკაშვილის ძმისთვის ადმინისტრაციული დარღვევისა და ჯარიმის შესახებ პროტოკოლის და გარკვეულ პერიოდში უკრაინის დატოვების შესახებ დოკუმენტის გადაცემა სურდათ. მას შემდეგ, რაც მიხეილ სააკაშვილმა საქართველო დატოვა და უკრაინაში გადაცხოვრდა, დავითიც ძირითადად ძმასთან იყო.
დავითის უფროსი ქალიშვილი ელენე სააკაშვილი შტატებში ცხოვრობს და ამჟამად ერთ-ერთ კვლევით ცენტრ Atlas Network-ის თამაშრომელია. ელენეს სოციალურ ქსელში სანდრა რულოვსთან ერთად გადაღებული ფოტოც აქვს გამოქვეყნებული.
რაც შეეხება მიხეილ სააკაშვილის მეორე ძმას, გიორგის, საზოგადოება ნაკლებად იცნობს. დავითისგან განსხვავებით, ის არასოდეს ჩნდებოდა მედიაში არც აქტიურობდა.
თუმცა სოციალურ ქსელში მისი ფოტოებიდან თუ ვიმსჯელებთ, ძმებს ახლო ურთიერთობა აქვთ და ძმის აქტიური მხარდამჭერია. გიორგის მეუღლე და ორი შვილი ჰყავს.